J Comput Biol: een nieuwe methode om het doelwit van antivirale geneesmiddelen of vaccins te voorspellen

Een nieuwe methode voor het voorspellen van de meest veelbelovende antivirale geneesmiddelen of vaccindoelen is gebaseerd op de conformationele veranderingen die virale glycoproteïnen ervaren tijdens herkenning en binding aan gastheercellen. Deze voorspellingsmethode is gericht op de waterstofbrug van de hoofdketen met het hoogste vrije-energiemotief. Gerelateerde onderzoeksresultaten worden gepubliceerd in het Journal of Computational Biology, een peer-reviewed tijdschrift dat is gepubliceerd door Mary Ann Liebert.

Robert Penner is de voorzitter van Rene Thom van het Franse Instituut voor Hoger Onderwijs (Bures-sur-Yvette) en UCLA Mathematical Biology. Hij is de auteur van dit artikel getiteld 0010010 quot; Backbone Free Energy Estimator toegepast op virale glycoproteïnen 0010010 quot;

Afbeeldingsbron: Mary Ann Liebert, Inc., uitgevers

Wanneer het virus de gastheercel binnenkomt en wordt geabsorbeerd, ondergaat het virus gewoonlijk een krachtige recombinatie, waarbij het een fusie- / infiltratiemotief vormt. Penner stelde een algemene methode voor om zeer conformationeel actieve residuen van de driedimensionale structuur van virale glycoproteïnen te voorspellen. De methode omvat het analyseren van de waterstofbruggen van het eiwit en het berekenen van de verschillen in vrije energie van de overeenkomstige kenmerken om de gebieden te bepalen waar de conformationele verandering het meest waarschijnlijk zal optreden. De in dit artikel voorgestelde methode wordt momenteel gebruikt voor het piekglycoproteïne van SARS CoV-2, dat COVID-19 kan veroorzaken.

Misha Gromov van het Institute of Advanced Science en de New York University zei: 0010010 quot; een wiskundig idee leidt direct tot een praktische betekenis, wat gewoon een wonder is, maar de beloning is enorm omdat het voorkomt in Maxwell {{1 }} # 39; s theorie van het elektromagnetische veld - het brengt radio en televisie en opent de deur naar theoretische berekeningen in onze digitale wereld. 0010010 quot; hij is een beroemde wiskundige en Abelprijswinnaar (ook bekend) als de Nobelprijs voor Wiskunde). 0010010 quot; Alleen als de auteur een vooraanstaande wiskundige is maar ook een brede wetenschappelijke horizon heeft, is zo'n idee mogelijk, en dit is zeldzaam onder de beste wiskundigen van onze tijd. Robert Penner is zo'n zeldzame wiskundige, hij ontdekte dat de methode van het eiwitstructuurpatroon anders is dan die van iemand anders in de wereld, en het eiwitstructuurpatroon is het resultaat van puur wiskundig denken. Deze methode zal waarschijnlijk een rol spelen en de ontwikkeling van antivirusgeneesmiddelen of vaccins versnellen. Maar alleen experimenten kunnen dit bewijzen. 0010010 quot; (Bioon.com)

bron: